交通部觀光署澎湖國家風景區管理處(下稱澎管處)針對民眾反映北海遊客中心拆除工程造成揚塵造成問題，原訂於112年9月份辦理拆除作業，惟經承租業者反映此舉將影響經營及服務品質，經協調改訂於112年10月份淡季期間辦理拆除作業。
因建築物拆除時易有煙塵，於工程辦理期間有採取灑水等防塵措施因應，於工程辦理拆除初期無明顯揚塵飄散問題，惟近期東北季風風勢較大，引致有煙霧瀰漫狀況，澎管處除立即要求承攬廠商立即改善外，澎湖縣環境保護局有派員至現場督察，並配合建議於拆除清運期間持續灑水及辦理防塵措施，且呂副處長玉鉛亦有會同承辦同仁至現場督察廠商落實辦理，煙塵狀況已有顯著改善，之後還會再視情況適度調整施工。
目前澎管處已要求廠商加派機具及人力進場加速拆除及運棄作業減少工程影響時間，並要求廠商增加灑水設備數量及防塵設施，拆除工程目前進度超前，依契約規定於112年12月初完工，預計在11月底前拆除完畢，營建土石方清運預計提前至112年11月21日前可辦理完畢，希望減少對周邊環境影響。