舉凡到澎湖旅遊的觀光客，幾乎都會攜帶一盒著名的黑糖糕回家，在澎湖，黑糖糕和一般人所謂「發糕（粿）」相似，最早常見用於祭拜祖先或紅白祭典，據說黑糖口味的發糕（粿）做法，早期是由日本沖繩縣（琉球群島）的糕餅師傅利用澎湖原有米發糕改良而成。
沖繩的黑糖是該地經濟產業，以黑糖製成的週邊產品種類相當多。由於澎湖在日治時期有部分沖繩人到澎湖定居做生意，其中開設糕餅店的沖繩糕餅師傅將原本澎湖當地製作的「米發糕（粿）」改良成現今的黑糖糕，並指導顏姓和陳姓兩位澎湖在地的糕餅師傅，後續並演變成為世代或師授傳承至今。
當時黑糖糕多半應寺廟或紅白祭典的需求，以預定方式由糕餅店秤斤論兩製作販賣。由於吃過的人都覺得口味不錯，加上澎湖觀光產業發展後，官方和民間大力推廣，讓許多具有澎湖在地特色風味的小吃美食成為知名的伴手禮，其中以黑糖糕的特殊口感和風味獲得業者和地方各界的推薦宣傳，才逐漸地打響黑糖糕名號。
隨著黑糖糕知名度愈來愈高、市場需求愈來愈大，直接或間接讓鬆軟、不黏牙且低糖等特殊風味的黑糖糕生產大增，澎湖當地糕餅店也紛紛自行研發製作並自創品牌加強精美包裝，使得澎湖黑糖糕猶如百家齊鳴、百花齊放一般，目前已成為澎湖旅遊最夯的伴手禮。
由於澎湖糕餅業者製作黑糖糕強調不添加防腐劑，因而縮短嚐味期限，所以店家會視實際銷售狀況和季節改變產量，旅遊旺季多作一些。淡季少作一些，目前多數店家，已經提供送貨到機場服務或者宅配服務，讓黑糖糕的通路更加完善，消費者亦可品嘗到新鮮可口的澎湖黑糖糕。


自製黑糖糕：
A. 材料：中筋麵粉一斤、太白粉半斤、黑糖一斤、發粉37.5g、水1000cc、白芝麻少許
B. 做法：
1. 中筋麵粉、太白粉、黑糖需先過篩去除粗顆粒，發粉先全部混合均勻再加水拌至稀糊狀。
2. 將步驟1倒入鋪有烘焙紙的長方型淺盤中，不需抹油。
3. 水燒開用中火蒸18-22分鐘，出爐，撒芝麻，冷卻切塊